冷冻研磨仪可以干磨、湿磨、混合以及均质化处理。对于提取大通量样品中的核酸，能大大提高研磨效率和质量。在研磨过程中，采用的是封闭式一次性离心管，避免了样品交叉污染。对同一组织样品设定相同的研磨程序，则可获得相同的研磨效率，提高了样品间的重复性。由于采用研磨球进行研磨，使得样品的研磨相较于传统研磨方式更为均匀、充分。可以作为匀浆器，利用不锈钢球或者高密度玻璃珠或者氧化锆珠子迅速分散样品，研磨、匀浆过程中样品温度不会上升，而且速度可调节。 在对样品DNA提取的实验分析中，样品前处理占据着重要作用，因此在使用冷冻研磨仪在开展样品的研磨前，这些准备工作需做好。
冷冻研磨仪对样品的操作只需1-3分钟便可完成2X96个样品的研磨粉碎。在对样品的破碎过程，通过其磨槽在水平方向上的圆弧径向摆动，在高频振荡的作用下，其磨槽内的磨球可在高速的冲击下粉碎样品，球体间的摩擦力冲击可有效地引起细胞破裂。
冷冻研磨设备在对试样的研磨前处理前，缓冲液需在低温下进行预冷，在准备几块冰块进行备用，在应用高浓度的乙醇对镊子、剪刀等研磨工具进行消毒灭菌。如果样品在运行过程中需要对其进行RNA等成分的提取，镊子、剪刀等物品需要再次用酒精消毒杀菌，以尽可能消毒RNA酶。
另，备好离心管置于冰块上作低温预冷处理，并在其添加适量的PBS缓冲液，再从零下80℃的冰箱中取出已研碎的组织样品，放置于冰面上，应用消毒过的镊子和剪刀将其样品切成小片，然后将其放入相对应的离心管中进行实验备用。
把离心管放到研磨设备的适配器中，开启研磨设备，设置样品的研磨参数，开启仪器程序的运行，研磨样品，待研磨仪器停止运行后，便可取出研磨后样品，进行后续的实验分析应用。
应用冷冻设备对样品的研磨，主要是可高效快速的完成研磨工作，且可避免样品间的交叉感染，对后续的实验操作分析结果减少影响。而其冷冻研磨仪对样品的研磨三要素更是深得实验者的喜爱。
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